* Су айдындарының әртүрлі түрлерінің әлеуетін және балық шаруашылығын оңтайлы пайдалануды анықтау үшін кешенді зерттеу.
* Балықтарға генетикалық зерттеулер мен генетикалық паспорттау жүргізу, балық өсіру шаруашылықтары үшін жеке және жаппай паспорттар әзірлеу.
* Балық өсіру шаруашылығын құру және жүргізу бойынша ғылыми-әдістемелік сүйемелдеу.
* Балық өсіру кәсіпорындары үшін балық отырғызу материалын, жемшөп пен технологиялық жабдықты сатып алу бойынша консультациялық қызметтер.
* Әр түрлі типтегі балық өсіру кәсіпорындары үшін жобалық құжаттаманы әзірлеу (көл-тауар, тоған, тор шаруашылықтары, индустриялық балық өсіру кәсіпорындары, жабық сумен жабдықтау қондырғысы).
* Балықты жасанды көбейту бойынша мамандарға кеңес беру және көмек көрсету.
* Балық өсіру кәсіпорындары мен фермерлік шаруашылықтар үшін бизнес-жоспар құруға жәрдемдесу.
* Әдістемелік көмек, балық шаруашылығының әртүрлі аспектілері бойынша кеңес беру.
* Балық шаруашылығы саласындағы зерттеулердің әртүрлі бағыттары бойынша биологиялық негіздемелерді, ғылыми әзірлемелер мен жобалардың есептерін рецензиялау.
* Шаруашылық қызмет нәтижесінде балық ресурстарына келтірілген залалды есептеу
* Шекті рұқсат етілген балық аулаудың биологиялық негіздемелерін әзірлеу.
* Балықтарды, жемшөп организмдерін интродукциялау (акклиматизациялау) үшін биологиялық негіздемелер және су айдындарын балықтандыру бойынша ұсыныстар әзірлеу.
* Балық шаруашылығы маңызы бар су айдындарының мәртебесін ауыстыру және өзгерту бойынша биологиялық негіздемелер әзірлеу.
* Оңтайлы балық қорғау құрылғыларын әзірлеу, жобалау және таңдау.
* Су айдындарындағы гидробиологиялық әртүрлілікті анықтау, балықтардың жемдік базасын бағалау
* Табиғи су айдындарында жемшөп организмдерін тұтыну және балықты азықтандыру дәрежесін анықтау.
* Су қоймаларының органикалық заттармен ластануын төменгі гидробионттардың – су бағанының және топырақтың сапробтық индикаторларының жай-күйі бойынша бағалау.
* Қолданыстағы технологияның, Артемия цисталарын терең өңдеу бойынша өндірістік қуаттардың сәйкестігі/сәйкессіздігі туралы қорытындыларды дайындау және беру.
* Артемия цисталарын, сондай-ақ басқа да құнды су омыртқасыздарын ұстауға рұқсат етілген биологиялық негіздемелерді әзірлеу.
* Гидрохимиялық көрсеткіштер бойынша су айдындарының әртүрлі түрлерін (су ағындары, тоғандар, жылы сулар және т.б.), судың әртүрлі шаруашылық қажеттіліктерге, оның ішінде балық шаруашылығына жарамдылығы туралы қорытындымен кешенді тексеру.
* Судың гидрохимиялық көрсеткіштерін; газ режимін (О2 және СО2), ортаның рН, Органикалық заттардың, физика-химиялық қасиеттерін, иондық және биогендік құрамдарды, минералды тұздарды анықтау, олардың шекті рұқсат етілген концентрация нормаларына су айдындарының шетелдік құбылыстарға ұшырау болжамымен сәйкестігін анықтау.
* Балық шаруашылығы су айдындарының гидрохимиялық жағдайын жақсарту бойынша ұсынымдар мен биологиялық негіздемелер әзірлеу.
* Тұзды су қоймаларының гидрохимиялық жағдайын жақсарту бойынша ұсыныстар мен негіздемелер әзірлеу.